Тематика водных маршрутов, посетить которые можно обычно с мая по сентябрь, разнообразна и зависит от специфики ООПТ. Продолжительность и протяженность таких маршрутов - от двух-трех часов до нескольких суток. Чаще всего интерес к такому виду отдыха проявляют и семьи и те, кто занимается сплавами давно и на достаточно высоком уровне. Специалисты рекомендуют на такие путешествия записываться заранее.

Такие сезонных путешествия дают возможность не только полюбоваться видами заповедной природы, но и ознакомиться с редкими видами флоры и фауны, принять участие в экскурсиях и мастер-классах, посетить визит-центры, музеи природы и многое другое.

Национальный парк «Бузулукский бор» (Самарская, Оренбургская области) приглашает на «Сафари по Боровке». Инфраструктура для сплава включает понтонные причалы, лестницы, трапы, столы и скамейки для обеда. Во время прохождения маршрута можно понаблюдать за дикими животными в естественной среде: лосей и косуль – на водопоях, бобров и ондатр – в воде, орланов и цапель – в воздухе. Туристам предоставляются горячее питание, ночёвки на территории глэмпинга, походная баня. Подготовку к путешествию можно осуществить на двух тренинговых площадках – на реке Боровка и на пруду Холодном.

Здесь же предлагают совершить водное путешествие на сап-бордах. Разработаны маршруты двух степеней сложности - для разных возрастных групп с различной степенью подготовки.

Протяженность маршрута «Бузулукское сафари» составляет 18 километров, а продолжительность – 1-2 дня. Это сложный маршрут, рассчитанный на подготовленных туристов, которые не боятся очень холодной воды, коряг, завалов и каменных перекатов и хотят увидеть красивейшие ландшафты и виды, в том числе ? знаменитый Среднеборовский яр – самый высокий и длинный обрыв на реке Боровка. Его высота достигает 30 метров, а протяженность – около 700 метров.

Второй маршрут – средней сложности, универсальный. Его протяженность составляет 15 километров, и он вполне подходит для сплава всей семьей. Туристы увидят Паникинский яр – единственное место в Бузулукском бору, где можно посмотреть коренные породы возрастом 250 миллионов лет. Видовая точка оборудована смотровой площадкой, которая находится на обрыве реки Боровки высотой 18 метров.

В заповеднике «Тунгусский» (Красноярский край) уже 15 лет существует водный маршрут по рекам Чамба и Хушма. Его протяженность 210 километров, 30 из них проходит по реке Подкаменная Тунгуска вне территории заповедника. Водное путешествие осуществляется на деревянных лодках-шитиках, приспособленных для прохождения узких мелководных таёжных рек. На маршруте можно посмотреть место эпицентра взрыва Тунгусского метеорита, а также посетить базу по изучению этого уникального явления. На берега рек Чамба и Хушма выходят лоси и медведи, многочисленны лебеди-кликуны.

Заповедник «Буреинский» (Хабаровский край) готов предложить гостям водный маршрут на катамаранах «Сплав по Правой Бурее» протяженностью 152 километра. Река обладает не очень сложными условиями для сплава, протекает в живописной долине, окружённой высокими горами. Особенно впечатляют пороги и перекаты, которые представляют собой целые каскады. Здесь обитает несколько видов хариуса, можно встретить медведя, лося, северного оленя, косулю в естественной среде обитания, потому что катамаран, в отличие от моторной лодки, не производит никакого шума. По ходу следования туристов на маршруте расположено несколько туристических стоянок и кордонов для ночлега. До начала сплава можно побывать на Умальтинском молибденовом руднике, увидеть процесс добычи золота на одном из старейших приисков Приамурья, а также пройти старой дорогой, по которой золото перевозили на верблюдах ещё в XIX веке.

Национальный парк «Мещерский» (Рязанская область) предлагает туристический водный маршрут «Пра Паустовского» протяжённостью 45 километров. Пройти его можно на байдарках, каякингах, сап досках. Гостей ООПТ ждёт рыбалка, сон под звёздным небом и еда, приготовленная на костре. «Изюминка» маршрута-заход на «Кордон 273», который посещал знаменитый писатель Константин Паустовский.

Другой водный маршрут нацпарка – «Озёрное ожерелье Мещёры» – разработан ещё во времена СССР. Его особенность в том, что одну его часть туристы проходят на байдарках, каякингах и сап-досках по течению реки, а другую - против течения. По пути следования туристов по каскаду озёр, который образует река Пра, разливаясь на два рукава, расположено более 15 археологических стоянок, а также храмы ХVIII-XIX веков в селе Стружаны и урочище Ялмонть. На 35-километровом маршруте расположены туристические стоянки «Можжевеловый рай», «Перышко» и «Рог».

В национальном парке «Югыд ва» (Республика Коми) разработан 128-километровый водно-экскурсионный маршрут по реке Подчерье. Своеобразие и живописность берегов этой небольшой реки делают её одной из наиболее популярных у туристов. Водный маршрут по Подчерье подходит для детского и семейного отдыха, для начинающих туристов-водников. На реке практически нет опасных порогов, а самыми сложными местами являются многочисленные мелкие перекаты. Главное украшение маршрута – скалы, тянущиеся по её берегам, окрашенные от серых до кирпично-красных оттенков. На маршруте можно совершить восхождение на гору Тима-из и посмотреть археологический памятник – святилище «Грот Арка».